南通市基督教兩會于2016年在第一城基督教堂升起了南通市基督教場所的第一面國旗。國旗的升起，讓南通教堂充滿了希望與活力。同時，市基督教兩會通過各種培訓、會議，舉行升國旗儀式。通過這莊嚴神圣的儀式，引導全市場所的教職人員的國家意識、民族意識和國旗意識。通過這二年的努力，啟東市基督教場所80%已經完成升國旗，市區的開發區和通州示范區的3所教堂全部完成了國旗進場所。海門市、通州區、如皋市、海安市等其他縣（市、區）場所，也著手發動國旗進場所的宣傳、引導工作。
國旗進場所是2018年市基督教兩會中國化建設的重要組成部分，也是南通基督教人士向祖國媽媽獻上的生日禮物。
